Среди корнеплодов морковь отличается самой плохой устойчивостью в хранении и дает большие потери от порчи. Это объясняется легкой повреждаемостью ее покровных тканей при уборке и перевозке. Механические повреждения на поверхности корнеплодов являются очагами для развития склеротинии и других грибных заболеваний. Эти особенности корнеплодов моркови надо обязательно учитывать при уборке урожая. Сроки уборки моркови устанавливаются в зависимости от сорта и необходимой спелости корнеплодов. При первой уборке морковь прореживают. Вторая сплошная уборка производится в сентябре - октябре, до наступления заморозков, так как корнеплоды моркови очень чувствительны к морозу. Убирают ее, как и столовую свеклу.
Выкопанные корнеплоды встряхивают, укладывают в кучи и острым ножом обрезают ботву (обрывать нельзя). Одновременно производят и сортировку моркови по качеству и величине корнеплодов.
Для хранения отбирают корнеплоды, освобожденные от земли, свежие, цельные, здоровые, без механических повреждений, по окраске и форме, свойственной данному сорту.
Морковь огородную и выращенную на полях, орошаемых сточными водами или удобренных фекальными компостами, не рекомендуется закладывать на длительное хранение, так как она имеет большую зараженность гнилями.
Не подлежат хранению корнеплоды моркови уродливой формы, с механическими повреждениями, неправильно обрезанной ботвой, пораженные вредителями и загнившие.
Выкопанные корнеплоды моркови отличаются высокой биологической активностью. Поэтому отобранную для хранения морковь в день уборки надо уложить в кучи и закрыть только землей слоем 15 - 20 сантиметров. В таком виде морковь проходит период неустойчивого покоя (несколько дней). После этого ее укладывают в сухие, чистые ящики емкостью не свыше 50 килограммов и в таком виде хранят в погребах. Но лучше всего морковь сохраняется в погребе в штабеле с песком. Штабель делают размером 1X1 метр. Сначала из сухого песка устраивают подушку (подстилку) и на нее кладут слой моркови, правильно выкладывая ее "валетом". Затем насыпают слой песка, вновь укладывают морковь и т. д. Можно штабель переслоить не песком, а сухими луковыми рубашками. Наиболее пригодной для зимнего хранения является морковь сорта Валерия.